Стовбур мозку містить як білу, так і сіру речовину. Сіра речовина стовбура мозку (тіла нейронних клітин) знаходиться в згустках і скупченнях по всьому стовбуру мозку, утворюючи ядра черепних нервів, ретикулярну формацію та ядра моста.
Ретикулярна формація (внутрішнє ядро сірої речовини знайдений у середньому мозку, мосту та довгастому мозку) покриву моста містить кілька груп клітин, які впливають на рухову функцію. Він також містить ядра кількох черепних нервів.
Ретикулярна формація – це структура, яка простягається через центральне ядро середнього мозку, хвостик і довгастий мозок. Це так в основному складається з пухких скупчень нейронів у білій речовині. Ретикулярні нейрони мають довгі аксональні зв’язки.
Ретикулярна формація складається з мережа дифузних агрегацій нейронів, розподілених по центральній частині довгастого мозку, моста та середнього мозку. Він заповнює простір між ядрами черепних нервів і оливковими тілами і перемішується між висхідними і низхідними волокнами.
Ретикулярна формація поділяється на три колони: ядра зв’язки (медіана), гігантоклітинні ретикулярні ядра (медіальна зона) і парвоцелюлярні ретикулярні ядра (латеральна зона). Ядра шва є місцем синтезу нейромедіатора серотонін, який відіграє важливу роль у регуляції настрою.
На відміну від будови спинного мозку, сіра речовина головного мозку присутня в зовнішній шар. Сіра речовина, що оточує головний мозок, відома як кора головного мозку. У головному мозку є дві основні кори, кора головного мозку та кора мозочка.