Що руйнує мікроРНК?

Зв’язування мікроРНК (міРНК) з мРНК зазвичай призводить до посттранскрипційної репресії експресії генів. однак, широке спаровування основ між мікроРНК і цільовими РНК може викликати деградацію мікроРНК, явище, яке називається деградацією мікроРНК, спрямованою на цільову РНК (TDMD).

Цільова деградація мікроРНК (міРНК) (TDMD) — це процес, за допомогою якого зв'язування мікроРНК з її когнатною РНК викликає деградацію мікроРНК, а не РНК, як це зазвичай відбувається. До цього часу було відомо лише про чотири встановлені приклади ендогенної TDMD, усі з яких стосувалися транскриптів ссавців.

Отже, дві мікроРНК можуть бути сильно пригнічені експресія одного інгібітора TuD з подвійним націлюванням, тоді як численні мікроРНК можуть бути націлені та придушені транскриптом мРНК, що експресується РНК-полімеразою II, що містить кластер шпильок TuD з подвійним націлюванням.

Стандартним методом інгібування функції мікроРНК (міРНК) є стеричне блокування— з використанням олігонуклеотиду, який ідеально комплементарний до зрілої мішені мікроРНК.

Вільна мікроРНК була деградована обробкою РНКазою протягом 30 хв (Рис. 2C). Клітинна мікроРНК була достатньо захищена від РНКази клітинною мембраною. Екзосомальна мікроРНК була частково захищена екзосомою. З іншого боку, вільна мікроРНК у культуральному середовищі негайно розщеплювалася РНКазою.

Існує три основні класи внутрішньоклітинних ферментів, що розкладають РНК: ендонуклеази, які розрізають РНК всередині, 5'-3' екзонуклеази, які розкладають РНК з 5'-кінця, і 3'-5' екзонуклеази, які гідролізують РНК з 3'-кінця.